活性炭最适合是放在网袋中然后再将它系紧固定。装满活性炭的袋子可以放在过滤槽中，必要时，活性炭被，可以强迫全部的水流通过活性炭，但在某种情况下这会增加过滤器运转的阻力并减低其效用。然而因为活性炭的作用非常的慢，所以建议采用部分的水流通过活性炭过滤器即可，活性炭，这样不会影响到过滤器的抵抗性。这个方法的好处在于好氧性与厌氧性细菌可以同时生长在过滤器中，好氧性细菌可行氧化分解作用，而厌氧性细菌会在活性炭的无氧地带，目活性炭，将硝酸盐分解成氮气。因此活性炭过滤材料会随着时间，糖活性炭，由化学的过滤性质转变为生物的过滤性质。活性碳多多少少都会掉碳粉，这是正常的。
活性炭具有一种强烈的“物理吸附”和“化学吸附”的作用：
可将某些有机化合物吸附而达到去除效果，利用这个原理，我们就能很快而有效地去除水族箱水质中的有害物质、臭味以及色素等等，使水质获得直接而迅速的改善。
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