从动物福利及养殖环境的改善角度认为，有机肥设备，养殖圈舍内应铺设垫料层，一方面有利于吸附动物排泄物，减轻环境污染，有机肥设备，另一方面也给动物提供了一舒适的地面环境。
许多研究表明，堆肥可用来替代锯末、秸秆粉等在养殖场作为垫料使用。
已经发现良好的堆肥可以在不适用化学药物控制的情况下减轻植物的土传病害。堆肥的这种抑制病害的特点已经开始被广泛地认识很赞赏。
在城市化和农业不断规模化发展的过程中，有机废弃物开始成为一种负担而不是财富。特别对一些农业养殖企业来说，由于没有大面积土地吸纳这些动物粪便，动物数量远远超过了土地的承受能力，造有机肥设备，使得粪便的处理就成了很头疼的问题，另外在城市垃圾及污泥的排放场所也普遍存在臭气问题，有机肥设备网，由此加剧了与附近居民的矛盾。
堆肥可以减轻这些问题的影响。由于堆肥产品通常有需求，因此其出路就不再是问题，堆肥可以储存和处理的性质允许它可以被运到比粪便或其他原料更远的地方。一个运行良好的堆肥设施基本不会产生臭气和滋生苍蝇的。
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