通过堆肥处理可以明显减轻原料的重量、水分和活性，便于后续操作，兔养殖设备，由于没有臭气和苍蝇问题它可以方便长期储存，随时使用，新型养殖设备，从而减少了原料堆放导致的径流和氮素损失。
有机废弃物的相当部分还在直接或简单处理后土地利用，虽也有肥料价值，并能起到改善土壤质量的作用，但还不能和堆肥相比。废弃物堆肥后使用具有以下优点：
（1）堆肥可以使废弃物中的氮素转变为更加稳定的有机氮，尽管其中也有部分氮素的损失，养殖设备，但剩余的氮素通常不容易被淋失和挥发掉
（2）初始废弃物碳氮比偏高或偏低，直接施用到土壤后，自动化养殖设备，会导致土壤中氮不足或者氮过量，影响作物生长，相反经过堆肥后碳素比趋于合理，更适合于土地利用
（3）堆肥过程产生的热量可以减少废弃物中杂草中子的数量，减轻了草害的影响
研究表明，在一定的温度下加热一段时间可以破坏病原体或者是令人讨厌的生物体。通常在60~70℃（湿热）的温度下，加热5~10min，可以破坏非芽孢细菌和芽孢细菌的非休眠体的活性。利用加热灭菌，在70℃条件下加热30min可以消灭污泥中的病原体。但在较低的温度下（50~60℃），一些病原菌的灭活则长达60天，因此堆肥过程中保持60℃以上温度一段时间是必须的。
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