生物有机肥中的枯草芽孢杆菌等有益微生物利用土壤中的有机质，产生次级代谢物，其中含有大量的促生长类物质。如生长素，能促进植物伸长生长；脱落酸，能促进果实成熟；赤霉素能促进开花坐果，增加开花数、保果率，提高产量，使果实饱满，色泽鲜嫩，还能提早上市。
有机肥中的微生物具有很强的生命力，在土壤中长期存活，新疆有机无机复合肥设备，固氮菌，解磷、解钾菌等微生物，可利用空气中的氮并释放土壤中不易被作物吸收的钾和磷，复合肥设备，持续供给作物养分，所以有机肥还具有长效性。
有机肥料的优越性：土壤中有机质含量的多少，是土壤肥力高低的主要指标之一，我省土壤有机质的含量普遍较低，一般只有1%左右，尤其是新平整的地块，有机质更少，有机质含量低，其土壤的物理化学性状就差(保水、保肥、结构等)因此它比化学肥料有许多优越性。
鸡粪、猪粪、人蓄粪尿、污泥、秸杆、杂草、炕胚土，各种废弃物、河泥、城市粪稀、污水、垃圾等。再有腐殖酸肥料、沼气池肥和豆科绿肥作物等等。
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