纸杯的较大功能就是用来装饮料，如碳酸饮料、咖啡、牛奶、冷饮等，这是它较早、较基本的用途。
饮料纸杯可分为冷杯和热杯两种。冷杯用来装冷饮料，如碳酸类饮料、冰咖啡等；热杯 用来装热饮料，如咖啡、红茶等。
区分冷饮杯和热饮纸杯，它们“各司其职”，广州纸杯厂，一旦“错位”，就会威胁到消费者的健康。 冷饮纸杯的表面要经过喷蜡或浸蜡处理。因为冷饮料会使纸杯表面积水，导致纸杯软化， 涂上蜡后便可防水。在在 0～5℃之间时这种蜡是非常稳定和安全。但如果用来装热饮只要 饮料的温度超过 62℃，蜡就融化纸杯会吸水变形，纸杯订做，融化后的石蜡杂质含量高，特别是它里面含有的多环芬烃有机化合物，是种可能致癌的物质，随饮料进入人体会危害人的健康. 热饮纸杯的表面会黏贴一层国家认可的特殊聚乙烯薄膜不仅耐热性好而且在高温饮料的浸泡下也无毒害. 纸杯应贮存在通风、阴凉、干燥及无污染的空间内，贮存期从生产日期起一般不要超过两年。
纸杯中的有害物质
纸杯在生产过程中可能会掺入不少的有害物质，上海纸杯，比如不法厂商使用了荧光剂，纸杯外壁喷涂图案用的颜料和助剂带入铅、砷及有机溶剂[5][6]，在存放过程中还有可能被微生物污染。
对于纸杯中的有害物质，行业标准中是这样规定的：
如果是符合标准的合格纸杯，其中含有的有害物质是很少的，不足以对人体造成危害。而要求纸杯中完全没有这些物质也是不可能的，纸杯，比如铅和砷，在自然界本身就存在，生产过程中只能降低其含量，彻底去除尽管在技术上可行，但是成本会很高，没有实际意义。将它们的含量限定在安全的范围内是比较合适的做法。
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