从动物福利及养殖环境的改善角度认为，粪肥发酵设备，养殖圈舍内应铺设垫料层，发酵设备，一方面有利于吸附动物排泄物，减轻环境污染，另一方面也给动物提供了一舒适的地面环境。
许多研究表明，堆肥可用来替代锯末、秸秆粉等在养殖场作为垫料使用。
已经发现良好的堆肥可以在不适用化学药物控制的情况下减轻植物的土传病害。堆肥的这种抑制病害的特点已经开始被广泛地认识很赞赏。
细胞的死亡很大程度上基于酶的热失活。在适宜的温度下，酶的失活是可逆的，有机肥发酵设备，但在高温下是不可逆的。热力学的观点表明，在一个很小的温度范围内酶的活性部分将迅速降低。如果没有酶的作用，细胞就会石区功能，然后死亡。只有少数几种酶能够经受住长时间的高温。因此，微生物对热失活非常敏感。
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